¿Estás probando la distribución en un entorno virtual tipo VmWare o Virtualbox?, de ser así asignale más RAM a la maquina virtual.

De todas formas me suena haber visto quejas de la combinación Blender/ffmpeg en algunos foros. La gente lo suele solucionar “a lo bruto”, sacando el render como una secuencia de imágenes, luego montan el vídeo-audio en otro programa y lo comprimen. No es la solución al problema pero puede ser una opción hasta que en futuras versiones lo corrijan.

Pero vamos, que debe ser un problema de Blender o de Ffmpeg, porque también se quejan personas que usan Blender en Windows o en otros distribuciones.

A la fecha eso no es cierto.
La versión de blender para ubuntu (9.04) 64bit que está en los repositorios (aún usando una nvidia) no es capaz de generar videos usando ffmpeg (blender se cierra). La versión de Blender de Ubuntu Studio (preinstalada) arroja un error al tratar de animar y se pega indefinidamente. El audio tampoco no funciona de buenas a primeras en las animaciones -en ninguna de estas dos distros-.

Si tienes problemas con alguna se pueden deber a 2 razones:
-Los drivers de la tarjeta gráfica, lo mejor para Blender es tener una Nvidia y usar los drivers propietarios. Los drivers de Ati e Intel para Linux aun tienen mucho que mejorar.
-Desactivar Compiz, los efectos de escritorio de Compiz son bonitos pero pueden crear problemas con algunos programas 3D.

Por lo demás, cualquier distribución te sirve. Las distribuciones pensadas para diseñadores gráficos lo único que tienen de especial es el software que traen de serie instalado.

Debian es una distribución estupenda pero quizás un poco difícil para gente que empieza en el mundillo de GNU-Linux. De todas formas tanto Ubuntu Studio, como Musix y Artistx están basados en Debian, por lo que encontraras muchas cosas en común.